Δυσαρεστημένο φέρεται να είναι το Οικουμενικό Πατριαρχείο μετά τις κοινές ανακοινώσεις για τα εκκλησιαστικά του πρωθυπουργού Αλέξη Τσίπρα και του Αρχιεπισκόπου Αθηνών και πάσης Ελλάδος, Ιερώνυμου.
Σύμφωνα με πληροφορίες του ΣΚΑΪ το Φανάρι δεν έχει ενημερωθεί από τον Αρχιεπίσκοπο Ιερώνυμο για την συμφωνία ή πρόθεση συμφωνίας με την πολιτική ηγεσία. Αυτό αν ισχύει έχει ιδιαίτερη σημασία με δεδομένο ότι τόσο η αυτοκέφαλη εκκλησία της Κρήτης, όσο και εκείνη των Δωδεκανήσων υπάγονται απευθείας στο Οικουμενικό Πατριαρχείο. Ως εκ τούτου παραμένει άγνωστο κατά πόσο δεσμεύονται οι δύο αυτές εκκλησίες από τα όσα ανακοίνωσαν από κοινού πρωθυπουργός και αρχιεπίσκοπος.
Ζητήματα αναμένεται να ανακύψουν και για την περιουσία των λεγόμενων «νέων χωρών», (κυρίως οι μητροπόλεις της Βόρειας Ελλάδας) που ναι μεν ανήκουν επισκοπικώς στην Εκκλησία της Ελλάδας ήδη από το 1928, ωστόσο θρησκευτικά υπάγονται στο Οικουμενικό Πατριαρχείο.
Εως τώρα δεν έχει υπάρξει επίσημη αντίδραση από την πλευρά του Φαναρίου.
